据教育部2010年公布的本专科专业就业状况显示，生物医学工程专业的就业率区间处于B+阶段，毕业生规模4000-5000人，该专业的平均就业率≥85%。　　

一般来说，生物医学工程专业的同学本科毕业后有几个方向：一是，读研究生继续深造，可在这一领域搞科研，或有更深入的发展；二是，进入国家医疗器械公司及各级医疗器械检测所；三是，到各级医院的医学工程处、设备处、信息中心以及医学影像科工作；四是，去各大跨国以及国内医疗器械企业，比如GE、SIEMENS、PHILIPS、MEDTRONIC、MAQUET、迈瑞、安科、鱼跃等，另外，就是各类医疗器械代理公司。

国外设备的大量引进客观上提高了对医学工程人才的要求。可以预见，未来的医学工程师已不仅仅停留在器械安装、调试等方面，越来越多的客户需要工程人员是“复合型”人才，能带给他们更多的增值服务。